孢囊
孢囊形成于动
细胞 之内，当甲分解为碎片时，孢囊从甲中释放出来。它是
有性生殖 的产物。亦称囊包、包囊体。但常误称为
孢子 。
原生动物 或低等
后生动物 分泌的坚固厚膜包于体表，使本身暂时处于休眠状态，称为囊包。
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孢囊
由
纤维素 构成的沟鞭藻的动细胞外壁——甲，不能保存为化石，只有那些休眠的孢囊才是古生物学家研究的主要部分。在化石记录中，孢囊最常见的为有机质壁，其次为钙质，少数为硅质的壁。在
中生代 及
新生代 地层中有机质壁的孢囊含量丰富；钙质孢囊一般常见于
侏罗纪 及
白垩纪 地层中，在第三系中数量较少；硅质孢囊出现于白垩纪中期至更新的地层中，尤其大量发现于古新世地层中（Stover et al.,1996）。
孢囊
外形在鉴定孢囊是十分重要的，最常见的孢囊形态为亚球形至椭球形。孢囊和动甲相对应，中部也被一个以纹饰或其它构造所指示的
横沟 划分为上孢和下孢两部分，纵沟则在腹面与横沟相交。同样对应地，上孢由顶系、沟前系和前间系组成，下孢由底系、沟后系和后间系等组成。每个系由一块至数块与甲板片对应，但不能分解的被称之为拟板片组成，拟板片的数量、形状、大小和排列方式反映了动甲板片的这些特点，主要由纹饰和突起指示。很多孢囊发育着不等数量和不同位置的角，使外形多变。
多甲藻 型——一个顶角，两个底角；
角甲藻 型——一个顶角，一个至两个沟后角 及一个底角。孢囊的形态也与轴的长短有关。孢囊在形成多具背——腹向扁于侧向的特征。
孢囊
孢囊的外壁在
透光镜 下一般可见有以下几层构造：原层、外层、内层、上层和中层。不同的孢囊的壁可以由以上各层的不同组合构成不同的外壁类型，主要为三种：
原层式——由原层构成，包围的空间为原腔；
双层式——或由外层和内层组成，形成内腔与外腔，或由原层和上层构成
三层式——或由内层、外层和中层构成，或由内层、外层和上层构成，外层与上层间具支持构造。
根据最新研究（Evitt et al.，1998）， Palaeoperidinium pyrophorum和P.cretaceum两个种都有一层石化的（被定义为超层，exophragm），形成于甲外的位置，并与甲的外表层紧密相连。
孢囊
囊包可分为下列各种类型。（1）保护囊包（resistance cyst德文 Schutzz－yste）：多为淡水产及寄生性的，由于囊膜的
物理 性和
化学 性稳定坚固，所以能耐受外界的干燥、高温和寒冷。（2）休眠囊包或
休眠孢子 （resting cyst，res-ting spore德文Ruhezyste）：是囊膜内的个体处于生理性休眠状态的囊包。（3）接合囊包（gamocyst德文Gamozyste）：是两个配子接触后，为同一囊膜包裹，然后相互接合形成接
合子 。（4）接合子囊包或接合子孢子（oocyst德文Oozyste）：是两配子接合后形成接合子，再分泌分泌物而形成的囊包。（5）孢子囊包（sporocyst德文Sporozyste）：是接合子在囊膜内经多次分裂而形成的囊包。因而也可称为增殖囊包（multiplication cyst德文Vermehrungsz-yste）。（6）传播囊包或传播孢子（propagationcyst）：是寄生原虫（例如
大肠阿米巴 ）以囊包状态进入新的
寄主 体内，然后在寄主体内脱去囊膜而裸露出来，再次进入活动状态。
孢囊
孢囊除古口外是一个不可分的有机体
由于孢囊和动甲都由同一活的物质——细胞质所产生，孢囊的外壁上往往发育反映动甲板片的构造，如组成动甲的板片的数量、形状、大小和排列方式，这些构成孢囊的拟板式。可分为：
非板式——纹饰和突起在孢囊表面随机或均匀分布，不能反映板式的；
板式——在孢囊表面依一定的、指示板式的规律分布，具体有以下几种类型：缝线位、角位和间角位、板内位、板缘位、间带位。
