2005年4月1日，由日本船舶与海洋基金会于2002年4月1日成立的日本海洋政策研究所正式更名为日本海洋政策研究基金会，日本各界把它称为日本的海洋事务智囊机构。
日本船舶与海洋基金会的前身是成立于1975年的日本造船促进基金会，当时的任务是促进日本造船工业和相关产业的发展，分析诊断日本造船和相关产业的管理工作，并帮助融资以支持其技术研究与开发活动和防止海洋石油污染等。随着世界海洋事务的发展，海洋为日本提供了越来越多的机遇，同时也使日本面临严峻的挑战，海洋工作在日本的议事日程中日趋突出，海洋政策研究基金会是这一大形势下的必然产物。
日本成立海洋政策研究基金会，是在美国“软实力”思想的启发下，为促进日本海洋领域“软实力”的发展而采取的重要举措。“软实力”思想是美国哈佛大学肯尼迪政府学院院长、著名政治学者Joseph S.Nye博士在20世纪80年代提出来的。众所周知，美国是世界强国，不仅有强大的军事实力，还有强大的经济实力。Joseph S.Nye博士提出，美国不仅要有“硬实力”，还要重视和发展“软实力”。他指出，美国不应通过强制手段来赢得世界，而是要抓住现代信息技术革命的新机遇，通过传播美国的思想、文化和生活方式，通过“理解”和“尊重”别国来得到世界。
日本的一些有识之士认为，日本是世界造船大国，在造船、航运、港口与码头等诸多方面有着雄厚的“硬实力”。尽管现在日本造船产业实力已不如以前，但在世界上仍有举足轻重的地位，还是世界一流的经济强国。但是综观世界一些海洋强国的发展趋势，日本一些关注海洋问题的人士认为，日本要想成为海洋强国，光有“硬实力”是不够的。为了使日本真正成为海洋强国，他们提出亟需加强海洋方面的 “软实力”建设，其措施之一就是成立海洋政策研究智囊机构。
日本海洋政策研究基金会宣称其宗旨是“促进人与海洋的和谐共处”，但也明确指出要为维护日本的海洋权益服务。实际上，推进日本的海洋事务，包括海洋管理事务，进而维护日本在海洋领域的权利和利益，才是它的确切宗旨。
为了担负起海洋智囊库的重任，日本海洋政策研究基金会组织动员各学科的研究人员参与研究工作。这些研究项目涉及海洋科学技术的各个领域，其中包括海洋政策、海岸带管理、海洋资源开发与保护、船舶技术和反恐等重点领域，同时还研究与海洋有关的社会问题。目前这些研究已经显现出明显的综合效应。
对于为什么现在需要建立海洋政策智囊机构的问题，日本有关人士认为，鉴于海洋与人类的关系涉及众多领域，在制定海洋管理政策时，必须依靠各方面专家的智慧。为了推进日本的海洋管理工作和政策制定工作，日本财团、日本船舶和海洋基金会以及国内外研究人员一道，建立了海洋政策智囊库，其目的在于打破行政管理部门和专业领域的局限，为日本，也为其他国家研究涉及海洋管理等方方面面的问题，并促进有关政策的实施。日本海洋智囊库的建立将成为一个新的转折点，使日本的海洋政策和海洋工作出现一个崭新的局面。http://www.dahai.ngo.cn/bbs/read.php?tid=383
