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微波加农炮的制造方法大部分都可在网上找到，而且制造的难度不高。这种炮弹属于电磁脉冲武器；电磁脉冲(EMP)是一种强力电场，可把射程范围内的电路灼毁。恐怖分子可能会把自制的微波加农炮放入飞机或者用它在陆上射向低飞的飞机，从而制造空难。沙哈尔指出：“随着电磁脉冲武器的科技发展越趋成熟，它构成的威胁将会进一步增加，因为只要恐怖分子知道飞机容易受到哪类型的干扰，他们便很容易可以发动攻击。”
飞机对电磁脉冲的防护不足。沙哈尔早前在伦敦的定向能武器研讨会上指出，虽然加装保护层的飞机可以阻挡电磁脉冲接触电路，但越来越多的飞机制造商采用难以防护力弱的碳纤维制造机身。
美国和俄罗斯的军队都已研发了电磁脉冲导弹弹头，亦有人猜测中东国家已经有恐怖分子把自制的微波加农炮用作武器。电磁脉冲武器亦有正面用途，譬如用来仿真核武爆炸对电路的影响(核武爆炸后会放出强大的电磁脉冲)以及测试电缆对雷击的抵御力。
